More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1784 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1784  ATPase  100 
 
 		 302 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  94.7 
 
 		 302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  92.67 
 
 		 300 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  89.33 
 
 		 302 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  86.42 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  85 
 
 		 303 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  82.37 
 
 		 314 aa  498  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  73.56 
 
 		 300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.15 
 
 		 300 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  69.15 
 
 		 309 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  69.76 
 
 		 303 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  64.47 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  66.78 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  67.35 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  66.78 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  66.78 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  65.19 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  65.4 
 
 		 314 aa  387  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  62.46 
 
 		 303 aa  384  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.09 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.29 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  61.38 
 
 		 296 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  60.9 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.62 
 
 		 302 aa  364  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.93 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  60.4 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  59.68 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  57.63 
 
 		 296 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.51 
 
 		 300 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  56.08 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.51 
 
 		 295 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.16 
 
 		 295 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  56.42 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  55.67 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  56.31 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  53.54 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.11 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  52.67 
 
 		 312 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.45 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.94 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  56.13 
 
 		 297 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  48.15 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  57.09 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  53.79 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  51.75 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  55.72 
 
 		 297 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.26 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.07 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  56.72 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  53.19 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  50.85 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  54.85 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.57 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  54.04 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  55.02 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  51.15 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.09 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  52.55 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  50.94 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  49.82 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.7 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.61 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  47.67 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.7 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  48.84 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.4 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.18 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.21 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.83 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  46.4 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  51.47 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  50.38 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  47.64 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.62 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  50.53 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  47.35 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  47.14 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  50.18 
 
 		 319 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.65 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.61 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.92 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  47.06 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.06 
 
 		 306 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.15 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.26 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  45.02 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  43.19 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.26 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.5 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  45.76 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  45.76 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  44.98 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  45.76 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.1 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  45.36 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  47.97 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  46.01 
 
 		 291 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>