More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2377 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
305 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.44 
 
 
314 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.03 
 
 
299 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  68.58 
 
 
300 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.32 
 
 
300 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  66.32 
 
 
296 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  63.21 
 
 
309 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.16 
 
 
300 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  63.82 
 
 
302 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  62.59 
 
 
303 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  62.58 
 
 
304 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.3 
 
 
302 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  66.32 
 
 
296 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  63.48 
 
 
302 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  62.42 
 
 
302 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  63.09 
 
 
302 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.54 
 
 
300 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  62.33 
 
 
314 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  61.82 
 
 
301 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  62.5 
 
 
303 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  60.33 
 
 
309 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  62.5 
 
 
304 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  64.58 
 
 
314 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  60.74 
 
 
314 aa  355  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  60.94 
 
 
304 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  62.14 
 
 
303 aa  352  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  60.61 
 
 
304 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  64.68 
 
 
318 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  59.26 
 
 
300 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.95 
 
 
304 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  60.07 
 
 
324 aa  329  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  59.29 
 
 
296 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.99 
 
 
295 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  57.99 
 
 
295 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.52 
 
 
297 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  57.54 
 
 
316 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  57.45 
 
 
291 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  57.04 
 
 
301 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  55.21 
 
 
294 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.6 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.6 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  62.78 
 
 
288 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  58.74 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.45 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  56.99 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.95 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.28 
 
 
308 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  55.97 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.03 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  52.67 
 
 
305 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  53.8 
 
 
298 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.75 
 
 
328 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  55.9 
 
 
312 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  54.36 
 
 
305 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  56.25 
 
 
293 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  53.74 
 
 
307 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  57.58 
 
 
280 aa  292  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  51.78 
 
 
328 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.96 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  55.8 
 
 
288 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.09 
 
 
302 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.32 
 
 
298 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.29 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  53.85 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  52.81 
 
 
298 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  54.51 
 
 
299 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.4 
 
 
322 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  49.52 
 
 
326 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.51 
 
 
323 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  51.18 
 
 
311 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.33 
 
 
326 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  48.8 
 
 
315 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.64 
 
 
291 aa  267  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  51.27 
 
 
300 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  47.23 
 
 
315 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  50.17 
 
 
293 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  47.87 
 
 
310 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.54 
 
 
295 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  46.75 
 
 
315 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  50.74 
 
 
297 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.25 
 
 
315 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  45.3 
 
 
316 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.85 
 
 
321 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.89 
 
 
302 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.58 
 
 
294 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.78 
 
 
284 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.12 
 
 
306 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.79 
 
 
306 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  48.81 
 
 
306 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  49.11 
 
 
302 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  52 
 
 
283 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.45 
 
 
299 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.57 
 
 
334 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  46.42 
 
 
319 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.18 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.9 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  50 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  46.08 
 
 
303 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  45.62 
 
 
295 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  45.62 
 
 
295 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>