More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2605 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2605  ATPase  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  87.42 
 
 		 302 aa  540  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  87.42 
 
 		 314 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  86.49 
 
 		 300 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  85.19 
 
 		 302 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  85 
 
 		 302 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  84.56 
 
 		 302 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  72.51 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.16 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  70.45 
 
 		 303 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  66.78 
 
 		 309 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  65.89 
 
 		 304 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  66.44 
 
 		 301 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  63.39 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  66.1 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  65.42 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  65.08 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  64.01 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  62.41 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.59 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.65 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.45 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  59.52 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  58.92 
 
 		 300 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  58.56 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  60.26 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.07 
 
 		 300 aa  351  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  58.59 
 
 		 296 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  57.24 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  59.65 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.82 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.82 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.3 
 
 		 295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  57.45 
 
 		 314 aa  335  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  56.76 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  57 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  52.82 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.16 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  52.67 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.84 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.26 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  58.21 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  54.84 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.74 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  48.46 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  57.09 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  53.29 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  53.19 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  54.74 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  53.17 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  51.23 
 
 		 316 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  53.33 
 
 		 291 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.11 
 
 		 323 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.45 
 
 		 298 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.73 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.35 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  50.17 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  53.65 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.23 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  49.16 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  50.88 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  50.76 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  50.18 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.13 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.67 
 
 		 296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  51.65 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  49.44 
 
 		 292 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.12 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  49.09 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  52.45 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  50.9 
 
 		 302 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  47.75 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  48.51 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  50.75 
 
 		 297 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  44.37 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.04 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.9 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  50.89 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.4 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  44.96 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.42 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  47.65 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  47.93 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.39 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  48.34 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.98 
 
 		 299 aa  252  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.55 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  45.86 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.38 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  45.86 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  46.18 
 
 		 291 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  47.06 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  45.52 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  45.94 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  46.88 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  45.91 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  46.74 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>