More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1229 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  87.42 
 
 		 302 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.24 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  73.43 
 
 		 291 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  70.63 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  72.03 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  72.03 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  72.03 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  70.63 
 
 		 291 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.61 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  71.58 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.88 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  69.57 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.76 
 
 		 299 aa  344  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  54.98 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.46 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.86 
 
 		 283 aa  299  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  55.67 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.24 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  53.95 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.03 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  52 
 
 		 303 aa  292  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  52.72 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  53.43 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  53.55 
 
 		 314 aa  291  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.4 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.92 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  53.61 
 
 		 306 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1932  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.56 
 
 		 421 aa  281  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  52.98 
 
 		 315 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.26 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.2 
 
 		 413 aa  279  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.26 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  55.35 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  53.28 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  50.35 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.52 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  53.45 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  53.42 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  53.68 
 
 		 291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  53.11 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  52.33 
 
 		 288 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.38 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  52.26 
 
 		 303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  50.36 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  48.04 
 
 		 316 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.23 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  51.64 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  49.29 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  51.99 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.21 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  48.52 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  50.18 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.48 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  51.47 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  49.1 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  51.47 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.63 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  51.13 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.74 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  49.11 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  51.67 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  50.75 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  49.64 
 
 		 297 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  52.29 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.12 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  48.4 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  48.82 
 
 		 333 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  48.2 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.7 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  50.38 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  51.33 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  51.66 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  48.44 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  49.06 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  51.33 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  50.38 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  50.57 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.24 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  49.25 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.74 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  47.7 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  50 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  48.01 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.21 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.21 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  47.33 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  48.58 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.7 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.87 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  47.1 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  47.87 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  50.19 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  46.05 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  49.82 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  51.79 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.13 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>