139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0599 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
381 aa  770    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  81.7 
 
 
378 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.03 
 
 
363 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  69.86 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  66.94 
 
 
376 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  67.59 
 
 
369 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  65.1 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  65.1 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  64.82 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  65.1 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.82 
 
 
362 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  64.54 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  64.27 
 
 
362 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  64.27 
 
 
362 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.56 
 
 
373 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.37 
 
 
369 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.32 
 
 
365 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.08 
 
 
385 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  51.73 
 
 
391 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  51.35 
 
 
300 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.26 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  42.02 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  42.13 
 
 
371 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.41 
 
 
379 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  45.94 
 
 
364 aa  265  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  41.9 
 
 
370 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  41.9 
 
 
370 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.1 
 
 
366 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  44.94 
 
 
355 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.54 
 
 
366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  43.54 
 
 
366 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  44.01 
 
 
359 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.44 
 
 
378 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  43.09 
 
 
360 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  45.22 
 
 
361 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.85 
 
 
366 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  42.18 
 
 
364 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.7 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.22 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  43.02 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  45.33 
 
 
395 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.18 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.84 
 
 
362 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41 
 
 
358 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.32 
 
 
380 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.99 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.41 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  28.49 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.66 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.77 
 
 
620 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.42 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.13 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.42 
 
 
297 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.4 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  27.23 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.27 
 
 
297 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.26 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.88 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  29.31 
 
 
899 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.02 
 
 
278 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  26.67 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  25.11 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  26.46 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.95 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.95 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.37 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  27.08 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  28.8 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  28.36 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.07 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  28.29 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  29.11 
 
 
853 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.04 
 
 
4979 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0388  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 
324 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.47 
 
 
729 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.88 
 
 
332 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  28.12 
 
 
348 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  25.62 
 
 
263 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  25.62 
 
 
263 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  25.66 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  28.25 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.57 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  25.41 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  27.55 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.03 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  27.87 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.24 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  28.09 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  25.71 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  25.65 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.49 
 
 
743 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>