196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4022 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  100 
 
 		 359 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  74.58 
 
 		 360 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.56 
 
 		 379 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.08 
 
 		 378 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  75.49 
 
 		 361 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  73.52 
 
 		 364 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  74.23 
 
 		 355 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  70.9 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.95 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  72.96 
 
 		 365 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.73 
 
 		 366 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.07 
 
 		 364 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.73 
 
 		 366 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.23 
 
 		 358 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  73.01 
 
 		 366 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.52 
 
 		 362 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.1 
 
 		 366 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.96 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.34 
 
 		 371 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  71.23 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.11 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.86 
 
 		 369 aa  295  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.86 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  45.89 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  44.05 
 
 		 370 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  43.41 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  46.93 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  43.37 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  45.03 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  47.35 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.01 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.19 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.09 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  42.32 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.58 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.6 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  41.6 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  41.87 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  41.6 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  41.6 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  41.6 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  41.92 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  41.32 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.6 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  40.55 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.49 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.77 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.38 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.93 
 
 		 620 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.59 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.17 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  29.82 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.82 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  31.52 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.82 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  29.39 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.79 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  28.77 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.17 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  28.44 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.39 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  29.03 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  27.78 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  29.96 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  26.57 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.09 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  26.27 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  26.67 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  27.88 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.14 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.11 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  28.85 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  29.7 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.62 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  26.29 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  27.12 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  25.85 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  27.27 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  25.11 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  26.83 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.14 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  28.5 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.6 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.12 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  28.95 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  26.24 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  24.14 
 
 		 4979 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  27.78 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  25.34 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.47 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  25.96 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.3 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  28.34 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  27.2 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>