215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6473 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  100 
 
 		 355 aa  707    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  88.03 
 
 		 361 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  81.07 
 
 		 378 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  80.67 
 
 		 364 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  74.23 
 
 		 359 aa  551  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  80 
 
 		 371 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.77 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.86 
 
 		 364 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.93 
 
 		 366 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  71.75 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.21 
 
 		 379 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.68 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.64 
 
 		 362 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  68.72 
 
 		 360 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.27 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.7 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  70.99 
 
 		 366 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.51 
 
 		 358 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  73.45 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  67.42 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.46 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.28 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  46.26 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.96 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  45.99 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  44.84 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  44.96 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  45.25 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  47.88 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.94 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.12 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  43.97 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  44.54 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.62 
 
 		 365 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  41.83 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  43.68 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  41.83 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.83 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  41.83 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  41.83 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  41.83 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  41.55 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.18 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.83 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  39.59 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.89 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.3 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  35.58 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  30 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  26.53 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.88 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.48 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  30.19 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.48 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.51 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.03 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  30.39 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.8 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  26.8 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  32.96 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.8 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.56 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  28.34 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.38 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  26.67 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  26.67 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  28.7 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  26.67 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.98 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.25 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.96 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.06 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  25.22 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.06 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  30.54 
 
 		 743 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.61 
 
 		 606 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  26.64 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  29.21 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  28.02 
 
 		 810 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  27.93 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  28.63 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  25 
 
 		 4979 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  27.32 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.4 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.22 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.21 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  30.48 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  27.59 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  28.5 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  24.43 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.91 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.63 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  30.19 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  27.19 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  27.59 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  33.14 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.47 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  25.64 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.72 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>