222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2407 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 362 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  80.78 
 
 		 378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.69 
 
 		 363 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  76.62 
 
 		 364 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  77.53 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  81.28 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.92 
 
 		 366 aa  534  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  73.52 
 
 		 359 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  75.64 
 
 		 355 aa  534  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  70.14 
 
 		 360 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.98 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  74.17 
 
 		 371 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.58 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  67.78 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  74.72 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.21 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  67.31 
 
 		 365 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.93 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.76 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  68.93 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.81 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.37 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.21 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  43.32 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  46.11 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  42.86 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  42.86 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  42.54 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  46.39 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.85 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.78 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  46.07 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.84 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  44.32 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  42.25 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  41.97 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  41.97 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  41.69 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.97 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  41.97 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  41.97 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.97 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  41.96 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.67 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  40.35 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.17 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.28 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.19 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  35.37 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.31 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  28.31 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  28.51 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  30.62 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  32.4 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  30.2 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  29.33 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  29.03 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  31.55 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.42 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  30.42 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.33 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  26.38 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  28.69 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.32 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  32.93 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  27.5 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  31.14 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  30.3 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  26.63 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  29.05 
 
 		 304 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  26.81 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  29.59 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.82 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  23.49 
 
 		 4979 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.82 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.8 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  27.78 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.1 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  28.99 
 
 		 288 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  27.23 
 
 		 298 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  29.33 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.4 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.78 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.41 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  27.19 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  25.93 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.91 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.96 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.53 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  26.98 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 278 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  27.69 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  27.72 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  30 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.64 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.93 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>