297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0255 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 361 aa  734    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.18 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.75 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  57.18 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.63 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  56.98 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  57.18 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  56.46 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.97 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  56.21 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  57.34 
 
 		 364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.02 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  56.11 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.3 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.5 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.65 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.81 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  56.63 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.74 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  56.09 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.38 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.51 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.68 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  46.5 
 
 		 378 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  44.72 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  43.72 
 
 		 370 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  44.32 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  44.01 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.26 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  43.58 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  45.53 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.42 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  43.22 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.99 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  44.07 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.16 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  40.9 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  40.9 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  40.9 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  40.9 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  40.62 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  40.9 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  40.9 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.9 
 
 		 362 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  39.79 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.4 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  30.5 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  25.16 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  28.92 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.04 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.21 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  30.97 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.42 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  29.36 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  26.94 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.9 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  30.5 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.91 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  27.18 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  27.16 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.79 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.5 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  27.04 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  27.04 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.5 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.57 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.37 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.88 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  28.71 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.62 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  28.15 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  27.51 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  28.06 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  31.29 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  28.37 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  28.22 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  28.22 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  27.21 
 
 		 620 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.86 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0462  MoxR family ATPase  30.3 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  26.15 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.06 
 
 		 307 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.6 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.96 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  31.58 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.03 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  24.37 
 
 		 302 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  26.83 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  26.7 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.61 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0388  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.61 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.61 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.86 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  27.55 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  27.59 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.17 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>