217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  90.22 
 
 
370 aa  678    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  90.22 
 
 
370 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  70.54 
 
 
372 aa  534  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.98 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  44.85 
 
 
378 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.76 
 
 
366 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41 
 
 
369 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.09 
 
 
373 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.72 
 
 
361 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.26 
 
 
378 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  46.88 
 
 
361 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.22 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  44.84 
 
 
364 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  43.41 
 
 
359 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  43.01 
 
 
360 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.65 
 
 
366 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  43.37 
 
 
366 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  41.84 
 
 
391 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.37 
 
 
366 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  42.01 
 
 
364 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  42.98 
 
 
363 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  44.84 
 
 
355 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.05 
 
 
385 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.44 
 
 
379 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.13 
 
 
381 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.92 
 
 
371 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.32 
 
 
363 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.32 
 
 
362 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.28 
 
 
364 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  46.31 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  42.34 
 
 
365 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  41.53 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.49 
 
 
358 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.13 
 
 
380 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.5 
 
 
362 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  39.5 
 
 
362 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  39.5 
 
 
362 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  39.23 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  39.23 
 
 
362 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  39.23 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.23 
 
 
362 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  38.95 
 
 
362 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  39.39 
 
 
376 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  37.07 
 
 
300 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.58 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.81 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.24 
 
 
620 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.43 
 
 
324 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.23 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  28 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  29.21 
 
 
305 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.7 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  28.84 
 
 
314 aa  57  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.01 
 
 
297 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.14 
 
 
291 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  24.77 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  27.75 
 
 
302 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.01 
 
 
297 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.44 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  28.35 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.44 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.23 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  29.03 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.1 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  27.48 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  26.84 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  26.63 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  25.23 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.19 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.88 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  27.32 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  26.64 
 
 
303 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.86 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.37 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  27.46 
 
 
300 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  26.8 
 
 
302 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  28.26 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.04 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.93 
 
 
729 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  29.61 
 
 
306 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  25.26 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.19 
 
 
300 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  25.79 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.83 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  27.69 
 
 
304 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.95 
 
 
290 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  28.09 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  24.51 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  25 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.85 
 
 
295 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>