139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1539 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  99.72 
 
 		 362 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 362 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  99.72 
 
 		 362 aa  743    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  99.17 
 
 		 362 aa  739    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  98.9 
 
 		 362 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  98.62 
 
 		 362 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  98.9 
 
 		 362 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  99.72 
 
 		 362 aa  743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  76.1 
 
 		 376 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.82 
 
 		 381 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.03 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  63.87 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  62.99 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  63.84 
 
 		 369 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.22 
 
 		 373 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.09 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  44.64 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.35 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  49.32 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  40.68 
 
 		 372 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  39.23 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  42.98 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  39.66 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  42.08 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.9 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  39.39 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.78 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  41.6 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.41 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  41.83 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.93 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.83 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.35 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  38.75 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  40.57 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  39.77 
 
 		 366 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.77 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  39.83 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.97 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.46 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  41.64 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.18 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.47 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.53 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.63 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.57 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.48 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  31.76 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  30.53 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.62 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.62 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.07 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.07 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.22 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.63 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  28.3 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  27.64 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.96 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.25 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  25.13 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  31.32 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  27.27 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  29.86 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  28.28 
 
 		 4979 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  26.97 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.12 
 
 		 853 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  28.99 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  26.09 
 
 		 668 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  27.31 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  26.58 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  27.07 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  27.07 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  28.8 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  27.04 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  25.36 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  30.85 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  27.96 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.67 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.14 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  28.26 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  27.8 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  26.84 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.96 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.5 
 
 		 810 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  26.42 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  27.06 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.62 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  26.9 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.27 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  26.9 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.87 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>