162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1359 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  100 
 
 		 655 aa  1351    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  64.82 
 
 		 810 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  58.85 
 
 		 609 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  58.85 
 
 		 609 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  58.26 
 
 		 734 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  60 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  48.76 
 
 		 459 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  48.76 
 
 		 459 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.26 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.02 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  45.54 
 
 		 805 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.15 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.3 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.5 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  38.24 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.71 
 
 		 568 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  42.58 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  40.49 
 
 		 743 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.19 
 
 		 698 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  36.33 
 
 		 629 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.69 
 
 		 754 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.45 
 
 		 683 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 743 aa  143  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  40.69 
 
 		 700 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  44.16 
 
 		 539 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.02 
 
 		 626 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.15 
 
 		 822 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  43.46 
 
 		 899 aa  138  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  42.49 
 
 		 587 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  44.09 
 
 		 678 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  40.31 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.44 
 
 		 765 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  39.52 
 
 		 450 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.07 
 
 		 685 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.9 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  38.89 
 
 		 303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  33.8 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  44.06 
 
 		 685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 		 590 aa  115  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  43.36 
 
 		 691 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  36.55 
 
 		 638 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  39.16 
 
 		 999 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.06 
 
 		 481 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  37.16 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.57 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  35.43 
 
 		 412 aa  104  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  34.78 
 
 		 653 aa  103  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  35.76 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  46.09 
 
 		 517 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  58.14 
 
 		 900 aa  100  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  49.12 
 
 		 517 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  30.39 
 
 		 352 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.73 
 
 		 398 aa  95.1  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.48 
 
 		 723 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  55.81 
 
 		 605 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  44.35 
 
 		 662 aa  94  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  44.74 
 
 		 603 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  46.49 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  55.29 
 
 		 862 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  51.14 
 
 		 571 aa  90.5  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  30.05 
 
 		 513 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  47.42 
 
 		 687 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.9 
 
 		 513 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  41.74 
 
 		 845 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.1 
 
 		 449 aa  87.8  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  51.06 
 
 		 834 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  39.07 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  33.52 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  51.72 
 
 		 722 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.52 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.35 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  31.68 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.57 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  26.37 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  25.58 
 
 		 843 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  25.58 
 
 		 847 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.92 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.83 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  25.12 
 
 		 844 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  26.9 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  26.9 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  24.65 
 
 		 844 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.54 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  30.81 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  24.42 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.83 
 
 		 668 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  27.27 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.11 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.32 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.78 
 
 		 559 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  29.38 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.95 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  27.03 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.33 
 
 		 796 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  27.72 
 
 		 391 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  27.32 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.52 
 
 		 679 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  26.37 
 
 		 371 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>