87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0252 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  84.34 
 
 		 498 aa  852    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  100 
 
 		 498 aa  1034    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  46.89 
 
 		 481 aa  342  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  43.1 
 
 		 685 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  43.1 
 
 		 691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.89 
 
 		 685 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  43.46 
 
 		 678 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  30.32 
 
 		 851 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  37.26 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.85 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  41.26 
 
 		 822 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  43.37 
 
 		 700 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30.97 
 
 		 666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.18 
 
 		 662 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.49 
 
 		 683 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  45 
 
 		 834 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  41.08 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  41.62 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  43.71 
 
 		 603 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  34.38 
 
 		 900 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  34.25 
 
 		 999 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.43 
 
 		 754 aa  143  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  30.48 
 
 		 705 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  41.3 
 
 		 862 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.39 
 
 		 696 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.44 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  39.22 
 
 		 805 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  39.61 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  39.61 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.51 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  45.39 
 
 		 598 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36 
 
 		 732 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  36.32 
 
 		 845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.94 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  34.16 
 
 		 687 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  45.64 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  36.87 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.2 
 
 		 722 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.18 
 
 		 765 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.6 
 
 		 568 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  32.1 
 
 		 609 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  32.1 
 
 		 609 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  38.43 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  34.33 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  32.44 
 
 		 810 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.51 
 
 		 502 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.04 
 
 		 698 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.06 
 
 		 729 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.04 
 
 		 626 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  37.16 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  32.86 
 
 		 734 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  31.47 
 
 		 853 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.96 
 
 		 743 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.08 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  38.31 
 
 		 743 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  40 
 
 		 899 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  29.63 
 
 		 638 aa  97.1  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  28.77 
 
 		 571 aa  95.5  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  29.2 
 
 		 412 aa  94.7  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  30.37 
 
 		 303 aa  94  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  28.63 
 
 		 352 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.34 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  32.06 
 
 		 781 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.38 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.43 
 
 		 513 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.07 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28.95 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.55 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.21 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.7 
 
 		 795 aa  67  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  27.18 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  21.65 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.05 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.33 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.58 
 
 		 530 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.93 
 
 		 748 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  35.79 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.79 
 
 		 679 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  35.79 
 
 		 578 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  28.1 
 
 		 803 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  22.99 
 
 		 714 aa  47  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  22.99 
 
 		 714 aa  47  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.4 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.76 
 
 		 914 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.5 
 
 		 559 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  26.82 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  27.89 
 
 		 599 aa  43.5  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>