53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1023 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1023  ATPase  100 
 
 		 599 aa  1226    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  36.7 
 
 		 589 aa  309  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  55.84 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  59.24 
 
 		 475 aa  223  9e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.21 
 
 		 651 aa  83.2  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  31.05 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.1 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  31.78 
 
 		 403 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.7 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.88 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  32.51 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  32.51 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.51 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  28.57 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  28.14 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  28.14 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  28.43 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.35 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  35.05 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.26 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  24.4 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.91 
 
 		 754 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  25.79 
 
 		 655 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  26.51 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  23.79 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  31.65 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.51 
 
 		 421 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  25.91 
 
 		 668 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.81 
 
 		 729 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.98 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  28.49 
 
 		 734 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  30.28 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 		 819 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.9 
 
 		 683 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.22 
 
 		 698 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  32.54 
 
 		 743 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  26.63 
 
 		 412 aa  47.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.91 
 
 		 822 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.58 
 
 		 662 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  23.53 
 
 		 678 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  23.62 
 
 		 700 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  29.13 
 
 		 805 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  45.24 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  25.96 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.01 
 
 		 732 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  27.56 
 
 		 685 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.81 
 
 		 306 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  27.8 
 
 		 587 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  31.15 
 
 		 598 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  26.28 
 
 		 691 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25 
 
 		 334 aa  44.3  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  25.12 
 
 		 371 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>