41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1943 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  100 
 
 
403 aa  784    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  44.22 
 
 
524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  42.71 
 
 
523 aa  259  8e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.5 
 
 
748 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.83 
 
 
651 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.37 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  31.78 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  36.76 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  33.17 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  34.36 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  27.91 
 
 
803 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  27.14 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  27.14 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.63 
 
 
465 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
729 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  25.19 
 
 
539 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.15 
 
 
606 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.87 
 
 
732 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  23.81 
 
 
938 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  29.8 
 
 
734 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.37 
 
 
698 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  28.21 
 
 
609 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  28.21 
 
 
609 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  27.71 
 
 
668 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.4 
 
 
853 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.95 
 
 
781 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.86 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  25.38 
 
 
655 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 
683 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.37 
 
 
603 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 
626 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  30.58 
 
 
899 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  26.21 
 
 
629 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
819 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.27 
 
 
765 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.32 
 
 
530 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.76 
 
 
795 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.1 
 
 
810 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  24.64 
 
 
743 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.3 
 
 
723 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  28.57 
 
 
999 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>