83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1992 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  100 
 
 
589 aa  1187    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  36.7 
 
 
599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  51.42 
 
 
475 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  52.11 
 
 
474 aa  219  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.94 
 
 
651 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  30.37 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 
748 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.27 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  33.68 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.51 
 
 
530 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  28.5 
 
 
523 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 
421 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  28.3 
 
 
524 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.73 
 
 
465 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  26.73 
 
 
459 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  26.73 
 
 
459 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  29.02 
 
 
743 aa  57  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.04 
 
 
819 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.89 
 
 
805 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.46 
 
 
732 aa  55.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  25.51 
 
 
668 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.04 
 
 
853 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.91 
 
 
307 aa  54.3  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.5 
 
 
743 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  26.14 
 
 
810 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  27.72 
 
 
781 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  26.13 
 
 
734 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 
754 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.49 
 
 
698 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  34.23 
 
 
629 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  25.32 
 
 
609 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  25.32 
 
 
609 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.4 
 
 
683 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  28.68 
 
 
899 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  26.2 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.98 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.46 
 
 
585 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.21 
 
 
729 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.98 
 
 
734 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.98 
 
 
734 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.37 
 
 
655 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  24.86 
 
 
571 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  45.76 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  33.6 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  45.76 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  45.76 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.94 
 
 
822 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  31.76 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.27 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  31.76 
 
 
371 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.24 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.37 
 
 
365 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.5 
 
 
334 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 
460 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.42 
 
 
304 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  30.47 
 
 
318 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  31.76 
 
 
438 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  26.37 
 
 
678 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.73 
 
 
530 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  30.34 
 
 
259 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  31.71 
 
 
303 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  25.36 
 
 
434 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  34.52 
 
 
436 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  31.25 
 
 
297 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  36.25 
 
 
439 aa  43.9  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  29.66 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  44.12 
 
 
440 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  29.66 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  25 
 
 
583 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  29.66 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  59.38 
 
 
735 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.84 
 
 
502 aa  43.9  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0786  IstB domain protein ATP-binding protein  32.23 
 
 
230 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.14 
 
 
453 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  33.91 
 
 
517 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>