82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1562 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 603 aa  1202    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.48 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  29.8 
 
 		 603 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.75 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  27.07 
 
 		 900 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.31 
 
 		 571 aa  131  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  39.17 
 
 		 638 aa  127  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  32.09 
 
 		 598 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  27.64 
 
 		 687 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.74 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  40.32 
 
 		 845 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.67 
 
 		 732 aa  99.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  26.98 
 
 		 741 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  39.6 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  39.6 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.67 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.8 
 
 		 729 aa  94.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  34.17 
 
 		 805 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  28.17 
 
 		 781 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  27.46 
 
 		 609 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.96 
 
 		 605 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  33.51 
 
 		 899 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  27.46 
 
 		 609 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.33 
 
 		 743 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  35.16 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.97 
 
 		 743 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.99 
 
 		 795 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  33.71 
 
 		 862 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.76 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.52 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  40.54 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.02 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  32.6 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.81 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.39 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.58 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  37.93 
 
 		 851 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.08 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  35.81 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  37.34 
 
 		 834 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  25.91 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  30.86 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  33.88 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.29 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  30.53 
 
 		 999 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.62 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.67 
 
 		 765 aa  78.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  39.39 
 
 		 705 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  34.22 
 
 		 678 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  34.08 
 
 		 691 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  33.52 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.09 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 568 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1740  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  36 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  30.98 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.76 
 
 		 822 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26 
 
 		 754 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  38.83 
 
 		 655 aa  67.4  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  38.2 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  25.62 
 
 		 352 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  24.21 
 
 		 303 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  44.62 
 
 		 450 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  33.05 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.69 
 
 		 510 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.6 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  27.74 
 
 		 513 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  32.54 
 
 		 653 aa  53.9  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  33.65 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.64 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  42.39 
 
 		 803 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  26.9 
 
 		 513 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.83 
 
 		 606 aa  50.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  25.37 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.26 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.7 
 
 		 530 aa  47  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  25.44 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  33.33 
 
 		 523 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.99 
 
 		 748 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>