76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0231 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 510 aa  1054    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  27.76 
 
 		 853 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  30 
 
 		 587 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  28.37 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  25.23 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.96 
 
 		 626 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.88 
 
 		 732 aa  90.1  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  30.38 
 
 		 899 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.15 
 
 		 678 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.35 
 
 		 822 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  28.29 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.56 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  25.69 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  28.57 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  28.57 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  25.2 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.11 
 
 		 683 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.47 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  32.12 
 
 		 862 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.63 
 
 		 698 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.04 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.71 
 
 		 810 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  32.47 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  32.28 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  31.52 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  29.82 
 
 		 691 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.38 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  29.67 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.27 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  29.67 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  30.91 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  33.12 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.21 
 
 		 685 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  31.82 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  25.77 
 
 		 781 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  31.02 
 
 		 734 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.24 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  27.17 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  25.17 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  32.9 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  33.33 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.42 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  32.69 
 
 		 845 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.81 
 
 		 754 aa  67  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  31.55 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  23.46 
 
 		 741 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  31.21 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.88 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.33 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  32.67 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.17 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  31.17 
 
 		 834 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  30.21 
 
 		 851 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  30.11 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.69 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.83 
 
 		 765 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.95 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  28.93 
 
 		 571 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  25.56 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  34.55 
 
 		 999 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.88 
 
 		 651 aa  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  24.63 
 
 		 803 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  25.38 
 
 		 666 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  24.87 
 
 		 352 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  24.56 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.56 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  24.73 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.98 
 
 		 4979 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.13 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.88 
 
 		 530 aa  43.5  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>