149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0379 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
410 aa  836    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 
626 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  35.2 
 
 
743 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.72 
 
 
683 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.2 
 
 
743 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  37.91 
 
 
629 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  33.33 
 
 
803 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.73 
 
 
698 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  31.09 
 
 
853 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.07 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  34.15 
 
 
899 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.77 
 
 
748 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.88 
 
 
765 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  33.54 
 
 
539 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.34 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  28.89 
 
 
938 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.68 
 
 
732 aa  77  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 
729 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.72 
 
 
502 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 
606 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  31.18 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.18 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  31.18 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.29 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.31 
 
 
530 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  28.27 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  28.93 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.24 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  27.23 
 
 
741 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  31.62 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.63 
 
 
781 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  30.57 
 
 
655 aa  70.1  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.56 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  31.13 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  31.16 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  31.13 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.18 
 
 
822 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  30.27 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.14 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  30.53 
 
 
700 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  29.9 
 
 
810 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  28.98 
 
 
734 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  44.58 
 
 
662 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  28.88 
 
 
678 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  43.37 
 
 
603 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  29.1 
 
 
587 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  29.35 
 
 
599 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  27.65 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.14 
 
 
723 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.32 
 
 
590 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  27.8 
 
 
705 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  29.41 
 
 
805 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.08 
 
 
685 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  31.85 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  40.24 
 
 
598 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  28.32 
 
 
687 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  33.64 
 
 
685 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  28.16 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.23 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  29.28 
 
 
900 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.94 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.97 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  38.55 
 
 
834 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  28.26 
 
 
666 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  31.9 
 
 
304 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  35.96 
 
 
571 aa  53.9  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  32.71 
 
 
691 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.9 
 
 
795 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  26.43 
 
 
524 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  26.62 
 
 
815 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  32.26 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  25.48 
 
 
845 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  34.52 
 
 
999 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  25.13 
 
 
653 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  36.84 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  36.59 
 
 
696 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  34.57 
 
 
498 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  29.07 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  36.25 
 
 
517 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  35.37 
 
 
498 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.46 
 
 
638 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  29.26 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  27.78 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  25.32 
 
 
735 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  25.25 
 
 
620 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  28.16 
 
 
280 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.75 
 
 
679 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.53 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  33.75 
 
 
862 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  27.61 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.26 
 
 
603 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  27.92 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  24.2 
 
 
712 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.78 
 
 
559 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.11 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.87 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  28.19 
 
 
334 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.29 
 
 
819 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>