55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0700 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0700  ATPase  100 
 
 		 714 aa  1422    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  100 
 
 		 714 aa  1422    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.15 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.15 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.71 
 
 		 698 aa  70.5  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  28.1 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.29 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  27.8 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  25.1 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  25.1 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.66 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.7 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  26.9 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  26.02 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.4 
 
 		 754 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  27.88 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  22.18 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  26.02 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.82 
 
 		 590 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.78 
 
 		 530 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  21.34 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.9 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.64 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.11 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  23.41 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  23.74 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  26.26 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.74 
 
 		 638 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.06 
 
 		 605 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  25.44 
 
 		 629 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 502 aa  54.3  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  24.09 
 
 		 743 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  23.53 
 
 		 700 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.02 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  24.06 
 
 		 666 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.54 
 
 		 732 aa  52.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.15 
 
 		 743 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.43 
 
 		 568 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25.64 
 
 		 303 aa  51.2  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.39 
 
 		 765 aa  51.2  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  25.1 
 
 		 352 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  25 
 
 		 781 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  29.48 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  18.1 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.82 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 795 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  29.55 
 
 		 598 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  28.8 
 
 		 845 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  23.04 
 
 		 853 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  28.99 
 
 		 662 aa  47.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  23.44 
 
 		 999 aa  47.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  21.93 
 
 		 899 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.44 
 
 		 822 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  26.11 
 
 		 597 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  25.2 
 
 		 571 aa  44.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>