80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4197 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  100 
 
 		 578 aa  1154    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  84.95 
 
 		 578 aa  990    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  51.83 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.14 
 
 		 542 aa  531  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  31.84 
 
 		 843 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  31.84 
 
 		 847 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  31.84 
 
 		 844 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.08 
 
 		 559 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  30.86 
 
 		 844 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  31.14 
 
 		 583 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.85 
 
 		 668 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.25 
 
 		 559 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.83 
 
 		 679 aa  173  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.52 
 
 		 751 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.63 
 
 		 568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.29 
 
 		 796 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.91 
 
 		 663 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  32.63 
 
 		 792 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  31.33 
 
 		 371 aa  133  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.86 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  35.58 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  26.86 
 
 		 605 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  26.25 
 
 		 605 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  28.75 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  28.75 
 
 		 609 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  28.75 
 
 		 609 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  32.08 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  28.75 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  30.51 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  28.73 
 
 		 880 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  28.12 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  28.75 
 
 		 609 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  25.24 
 
 		 605 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  27.51 
 
 		 606 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  26.49 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  35.19 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  42.75 
 
 		 735 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  38.66 
 
 		 778 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  31.96 
 
 		 716 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  33.81 
 
 		 671 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0882  hypothetical protein  30.45 
 
 		 378 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  27.29 
 
 		 755 aa  90.9  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  24.76 
 
 		 636 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  28.87 
 
 		 454 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  33.5 
 
 		 377 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.06 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  28.21 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  28.21 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.22 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.22 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.61 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1222  hypothetical protein  26.37 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.14 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  28.14 
 
 		 459 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  28.14 
 
 		 459 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  24.5 
 
 		 734 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.19 
 
 		 732 aa  55.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.58 
 
 		 333 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.87 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  33.33 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.53 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  24.73 
 
 		 805 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  33.64 
 
 		 685 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  32.31 
 
 		 700 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  35.79 
 
 		 498 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.84 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20 
 
 		 683 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  27.65 
 
 		 743 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  27.27 
 
 		 741 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  23.86 
 
 		 653 aa  48.5  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  36.46 
 
 		 498 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.65 
 
 		 743 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30.97 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.53 
 
 		 678 aa  47  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  22.7 
 
 		 781 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  23.95 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.63 
 
 		 853 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2776  hypothetical protein  23.88 
 
 		 349 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.15 
 
 		 410 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.97 
 
 		 822 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>