75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0045 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  84.95 
 
 
578 aa  990    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  100 
 
 
578 aa  1162    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  52.22 
 
 
549 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.14 
 
 
542 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.83 
 
 
559 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  31.91 
 
 
583 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  30.29 
 
 
844 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  30.9 
 
 
847 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  30.9 
 
 
843 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  31.67 
 
 
844 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.48 
 
 
668 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.3 
 
 
559 aa  193  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.67 
 
 
679 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.74 
 
 
568 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  34.48 
 
 
751 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.46 
 
 
796 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.65 
 
 
663 aa  144  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  30.56 
 
 
371 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  32.22 
 
 
792 aa  137  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.22 
 
 
914 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  28.48 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  29.54 
 
 
880 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  26.35 
 
 
605 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  26.35 
 
 
605 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  28.45 
 
 
735 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  30.57 
 
 
606 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  29.12 
 
 
564 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  45.97 
 
 
712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  26.83 
 
 
605 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  25.24 
 
 
605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  26.84 
 
 
606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  26.84 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  26.84 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  26.84 
 
 
606 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  26.84 
 
 
609 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  26.05 
 
 
606 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  26.2 
 
 
606 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  39.18 
 
 
778 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  34.29 
 
 
671 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  30.28 
 
 
716 aa  98.2  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  25.71 
 
 
755 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  33.75 
 
 
454 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  25.24 
 
 
636 aa  93.6  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  29.52 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0882  hypothetical protein  26.04 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  26.82 
 
 
655 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.93 
 
 
810 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.31 
 
 
568 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1222  hypothetical protein  25.76 
 
 
354 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  26.26 
 
 
609 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  26.26 
 
 
609 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.04 
 
 
333 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  25.61 
 
 
734 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.96 
 
 
685 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.59 
 
 
698 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  33.67 
 
 
685 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.03 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  32.65 
 
 
691 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  27.03 
 
 
459 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  27.03 
 
 
459 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  24.19 
 
 
805 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 
732 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.4 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  35.79 
 
 
498 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.29 
 
 
729 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20.07 
 
 
683 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  31.58 
 
 
678 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2776  hypothetical protein  24.38 
 
 
349 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  32.41 
 
 
700 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  31.78 
 
 
666 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  24.61 
 
 
781 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  34.74 
 
 
498 aa  45.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.63 
 
 
853 aa  44.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.09 
 
 
743 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  23.28 
 
 
705 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>