57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1328 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 796 aa  1617    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  31.42 
 
 		 751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.78 
 
 		 542 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  31.68 
 
 		 844 aa  164  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  32.23 
 
 		 844 aa  163  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  26.66 
 
 		 734 aa  161  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  31.96 
 
 		 847 aa  160  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  31.96 
 
 		 843 aa  160  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  25.73 
 
 		 781 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.24 
 
 		 578 aa  151  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  35.95 
 
 		 549 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.11 
 
 		 668 aa  144  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  38.06 
 
 		 578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32 
 
 		 559 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.11 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.93 
 
 		 914 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  31.58 
 
 		 583 aa  127  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  33.11 
 
 		 371 aa  124  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  38.5 
 
 		 792 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  28.61 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  30.79 
 
 		 606 aa  117  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  29.09 
 
 		 454 aa  114  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  26.78 
 
 		 636 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  34.71 
 
 		 671 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  30.47 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.62 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  40.35 
 
 		 778 aa  101  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.83 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  27.03 
 
 		 755 aa  98.2  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  35.15 
 
 		 605 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  35.93 
 
 		 605 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  32.34 
 
 		 605 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  29.63 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  29.63 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  29.63 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  29.63 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  26.91 
 
 		 436 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  29.11 
 
 		 606 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  29.17 
 
 		 606 aa  90.9  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  29.17 
 
 		 609 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  33.53 
 
 		 605 aa  90.1  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  35.08 
 
 		 716 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  40.74 
 
 		 735 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  40.74 
 
 		 712 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.33 
 
 		 655 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.52 
 
 		 810 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  26.56 
 
 		 743 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.36 
 
 		 421 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.69 
 
 		 626 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  33.64 
 
 		 496 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.13 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 743 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2440  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  30.65 
 
 		 753 aa  45.8  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  28.74 
 
 		 377 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2798  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  25.93 
 
 		 794 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  31.58 
 
 		 741 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>