97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2172 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  55.06 
 
 
843 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  54.53 
 
 
844 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  54.17 
 
 
844 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
559 aa  1152    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  55.06 
 
 
847 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.91 
 
 
559 aa  856    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  41.82 
 
 
583 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  53.05 
 
 
792 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.63 
 
 
668 aa  342  8e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  35.71 
 
 
679 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  31.89 
 
 
606 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.44 
 
 
568 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  32.08 
 
 
578 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.83 
 
 
578 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.87 
 
 
542 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  35.29 
 
 
549 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.78 
 
 
914 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  36.44 
 
 
371 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  32.39 
 
 
436 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 
663 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  31.5 
 
 
636 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  28.6 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32 
 
 
796 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  26.4 
 
 
712 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  30.85 
 
 
564 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.12 
 
 
751 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  27.9 
 
 
605 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  28.5 
 
 
755 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  26.48 
 
 
605 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  26.81 
 
 
606 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  25.82 
 
 
605 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  27.11 
 
 
606 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  27.11 
 
 
609 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  27.11 
 
 
609 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  27.11 
 
 
606 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  26.81 
 
 
606 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  27.11 
 
 
609 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  25.53 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  38.46 
 
 
735 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  30.75 
 
 
671 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  35.75 
 
 
778 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  28.09 
 
 
880 aa  90.9  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  34.62 
 
 
716 aa  86.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  31.02 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  31.28 
 
 
201 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  29.95 
 
 
197 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  30.26 
 
 
197 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  29.95 
 
 
197 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  36.49 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0882  hypothetical protein  25.86 
 
 
378 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  25 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  34.35 
 
 
205 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  25 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  28.28 
 
 
201 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.03 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  30.89 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  31.62 
 
 
431 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  30.89 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  31.89 
 
 
899 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.87 
 
 
333 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.25 
 
 
698 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  26.53 
 
 
781 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  25.29 
 
 
810 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  29.07 
 
 
743 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.37 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  26.78 
 
 
655 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  23.46 
 
 
734 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.65 
 
 
743 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 
502 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  23.7 
 
 
609 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  23.7 
 
 
609 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  25.37 
 
 
741 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  29.45 
 
 
853 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  23.98 
 
 
805 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.03 
 
 
568 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  29.08 
 
 
367 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 
729 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2776  hypothetical protein  28.9 
 
 
349 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.34 
 
 
626 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  24.18 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.95 
 
 
732 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.7 
 
 
590 aa  47.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.14 
 
 
678 aa  47  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  26.01 
 
 
705 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.55 
 
 
585 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  26.57 
 
 
597 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  27.91 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  27.91 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  27.91 
 
 
333 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  29.7 
 
 
700 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  25.77 
 
 
653 aa  44.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.29 
 
 
822 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.44 
 
 
638 aa  44.3  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1222  hypothetical protein  25.13 
 
 
354 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  30.82 
 
 
603 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.88 
 
 
571 aa  43.5  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>