169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1512 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  98.09 
 
 		 366 aa  727    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 366 aa  735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  98.36 
 
 		 366 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.3 
 
 		 379 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  72.73 
 
 		 359 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.9 
 
 		 378 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  70.06 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  72.16 
 
 		 361 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  69.12 
 
 		 360 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  71.27 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.16 
 
 		 363 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.04 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.32 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.86 
 
 		 364 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  68.17 
 
 		 364 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  70.57 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.21 
 
 		 362 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  66.1 
 
 		 365 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.57 
 
 		 380 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.76 
 
 		 371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.75 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.62 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.11 
 
 		 373 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  47.09 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  43.65 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  44.5 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  44.26 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  42.54 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  44.79 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  42.54 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  43.02 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.5 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.57 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.74 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.1 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  42.35 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  40.63 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  40.63 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  40.63 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  40.35 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  40.35 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  40.35 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  40.35 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.35 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  40.21 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.5 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.93 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.65 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.12 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.24 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  26.87 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.32 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.13 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  27.5 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.85 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.2 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  27.55 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.73 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  28.3 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  27.06 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.8 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  28.73 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  27.54 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.25 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.65 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  28.07 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.42 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  24.9 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  26.92 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  27.48 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  25.88 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  26.18 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.06 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  25.87 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.1 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  26.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  26.78 
 
 		 743 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.34 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  29.44 
 
 		 655 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.88 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.41 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.39 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  27.31 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.39 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.96 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  26.18 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0388  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>