240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0132 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
369 aa  758    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.21 
 
 
373 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.37 
 
 
381 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  54.75 
 
 
378 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.97 
 
 
363 aa  349  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.69 
 
 
365 aa  344  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  51.83 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  49.32 
 
 
391 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  48.61 
 
 
363 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50 
 
 
362 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  50 
 
 
362 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  50 
 
 
362 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  49.72 
 
 
362 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 
362 aa  328  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  49.44 
 
 
362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  49.44 
 
 
362 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  51.11 
 
 
369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  49.16 
 
 
362 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.41 
 
 
385 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  46.17 
 
 
364 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.68 
 
 
361 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  45.86 
 
 
359 aa  295  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  44.11 
 
 
360 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  41 
 
 
371 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.62 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.36 
 
 
378 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  45.43 
 
 
366 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.43 
 
 
366 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  45.15 
 
 
361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  43.77 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.23 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.41 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  43.96 
 
 
355 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  40.22 
 
 
370 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.48 
 
 
379 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  44.29 
 
 
365 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  39.94 
 
 
370 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.08 
 
 
366 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.3 
 
 
371 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  39.55 
 
 
372 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.6 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.21 
 
 
362 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  45.76 
 
 
300 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.28 
 
 
380 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  43.32 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.13 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.95 
 
 
295 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  30.48 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.16 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  28.92 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  29.52 
 
 
298 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  29.52 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.88 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  27.65 
 
 
294 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  30 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  28 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.79 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.79 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  30.33 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  26.56 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  25.71 
 
 
318 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  27.17 
 
 
320 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  27.84 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  27.32 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  25.95 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.6 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.38 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  27.51 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.06 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.65 
 
 
620 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  25.98 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  26.4 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.42 
 
 
327 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.1 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.42 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  26.03 
 
 
292 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.4 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.4 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.74 
 
 
318 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.44 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  25.13 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.34 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.29 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  28.11 
 
 
301 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  27.54 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  29.82 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  26.94 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  24.21 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  26.94 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  26.94 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.32 
 
 
327 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.71 
 
 
297 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>