224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3407 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3407  ATPase  100 
 
 
372 aa  764    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  70.54 
 
 
371 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  69.67 
 
 
370 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  69.4 
 
 
370 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.8 
 
 
365 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.73 
 
 
363 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  43.82 
 
 
378 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  46.34 
 
 
361 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  43.38 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.82 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.01 
 
 
361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  45.14 
 
 
355 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  40.98 
 
 
391 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  44.14 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.55 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.02 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.25 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.32 
 
 
379 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  42.98 
 
 
359 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  42.62 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.29 
 
 
366 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.02 
 
 
366 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  40.96 
 
 
362 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  40.96 
 
 
362 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  40.96 
 
 
362 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  40.96 
 
 
362 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  40.96 
 
 
362 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  41.6 
 
 
360 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  42.18 
 
 
369 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  40.68 
 
 
362 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.05 
 
 
385 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  42.46 
 
 
366 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  40.68 
 
 
362 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.96 
 
 
362 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.38 
 
 
363 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.46 
 
 
366 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.19 
 
 
371 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.31 
 
 
364 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  40.95 
 
 
365 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.58 
 
 
358 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  44.08 
 
 
395 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  41.05 
 
 
376 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.54 
 
 
362 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.88 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  37.93 
 
 
300 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.59 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.69 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.72 
 
 
620 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  30.73 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  30.1 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  31.28 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  30.99 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
297 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  28.87 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  33.55 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.12 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  28.7 
 
 
294 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.47 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  28.43 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.88 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  31.34 
 
 
304 aa  56.6  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  29.02 
 
 
314 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  26.54 
 
 
297 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  26.09 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  28.42 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  25.78 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.35 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.1 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  28.24 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  28.24 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  28.42 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  27.45 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  28.16 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.87 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  28.42 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.87 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.87 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.87 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.87 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.87 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  29.65 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.87 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.87 
 
 
297 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  28.5 
 
 
288 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  27.48 
 
 
295 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  26.89 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  25.61 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  26.56 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  28.78 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  27.48 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  26.2 
 
 
281 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.1 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  29.49 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  26.67 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  27.96 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  27.62 
 
 
292 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  23.29 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  25.41 
 
 
312 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>