204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0756 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 358 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  73.8 
 
 		 364 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  71.23 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.55 
 
 		 379 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  71.79 
 
 		 360 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.45 
 
 		 378 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.32 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  69.77 
 
 		 365 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  67.51 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  68.75 
 
 		 366 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.47 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  67.79 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  65.73 
 
 		 364 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.41 
 
 		 364 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.82 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.76 
 
 		 362 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.95 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.97 
 
 		 363 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.04 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  64.89 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.3 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.6 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  42.08 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  41.19 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.66 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  42.47 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  42.21 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.76 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  43.06 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.59 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  42.27 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  41.33 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  43.58 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.78 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.67 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  39.34 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  39.34 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.34 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  39.34 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  39.34 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  40.56 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  39.06 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  39.06 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.06 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  41.08 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.73 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.87 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  29.56 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.82 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.16 
 
 		 620 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.9 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  28.88 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.18 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  27.67 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  29.05 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  28.57 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.53 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.31 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  27.86 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.5 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  29.03 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  25 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  27.46 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.16 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  27.04 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.16 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.09 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.92 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.94 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  29.78 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  26.57 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.71 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.71 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.07 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  27.92 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  27.35 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.24 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  26.72 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.41 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  27.54 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  27.86 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  27.17 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  27.5 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  24.02 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.27 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  25.43 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.21 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  26.83 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.08 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.62 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  26.11 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  25.84 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.32 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  27.08 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  26.47 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  25.62 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  25.85 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>