141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1887 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 363 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  80.11 
 
 		 378 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.03 
 
 		 381 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  67.49 
 
 		 363 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  64.29 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  63.31 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  63.31 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  66.2 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  63.31 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.03 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  63.03 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  62.75 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  63.03 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  62.75 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.49 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.97 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.94 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.91 
 
 		 385 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  49.74 
 
 		 391 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  51.17 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  43.45 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  42.34 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  42.22 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  43.86 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.42 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.74 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.94 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  42.46 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.46 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.22 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  43.18 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  43.58 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  42.94 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.96 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  42.74 
 
 		 361 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  40.39 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  42.86 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  41.18 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  45.18 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.09 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.73 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.55 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.57 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.96 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.67 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.24 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.36 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.34 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  29.94 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.26 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.57 
 
 		 853 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.73 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  27.5 
 
 		 291 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.82 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  26.56 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  27.23 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.94 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  26.58 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.77 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.77 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.67 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  25.93 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  26.98 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  28.36 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  29.02 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  25.63 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.18 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  27.8 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.71 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  29.72 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  27.93 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  28.27 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  27.93 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  27.42 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  27.93 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  26.09 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  28.37 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.93 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.21 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  27.37 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  28.85 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.85 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  27.59 
 
 		 899 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.04 
 
 		 4979 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.2 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.19 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.16 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  28.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.38 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.57 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  31.64 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  25.7 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  25.25 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  24.27 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  27.72 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  27.66 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.47 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  22.29 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  22.29 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>