248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3739 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  100 
 
 		 365 aa  743    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  80.9 
 
 		 360 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  77.68 
 
 		 364 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  72.96 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.32 
 
 		 379 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.34 
 
 		 378 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.77 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.95 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  65.74 
 
 		 364 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  67.42 
 
 		 355 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.31 
 
 		 363 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  64.56 
 
 		 361 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.95 
 
 		 364 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.31 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.49 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.1 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  66.67 
 
 		 366 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.67 
 
 		 366 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.57 
 
 		 371 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  67.61 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.09 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.29 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.01 
 
 		 373 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  42.34 
 
 		 371 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  42.53 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  42.53 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  40.95 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  44.69 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.21 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  43.43 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.98 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  42.93 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  45.25 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.41 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.83 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  39.83 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  39.83 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  40.11 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  39.83 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  39.83 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  39.54 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.83 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  40 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  40.28 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.36 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  34.55 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.02 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  31.58 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.74 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  34.17 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.37 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  30.91 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  30.92 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  32.45 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  30.51 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.79 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.13 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  27.31 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.5 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  28.21 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.23 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.45 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.09 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.22 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.91 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  28.64 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  27.7 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  28.07 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  29.65 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  25.98 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.45 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  28.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.05 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.07 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  28.81 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.86 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  27.04 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.07 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.72 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  25.57 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  27.46 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  29.05 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  29.13 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  29.61 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  27.23 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  23.89 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  29.06 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  25.76 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  27.78 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.33 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  27.11 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  29.44 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.7 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  28.77 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  29.23 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  28.7 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>