197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4683 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 366 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.03 
 
 		 363 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  76.26 
 
 		 364 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.07 
 
 		 378 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  74.59 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  74.93 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  79.32 
 
 		 380 aa  537  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.59 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.92 
 
 		 362 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  71.1 
 
 		 359 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.01 
 
 		 371 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  69.27 
 
 		 360 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.04 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  68.77 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.77 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.71 
 
 		 379 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  68.95 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  66.01 
 
 		 364 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  71.47 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.82 
 
 		 358 aa  481  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.65 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  46.76 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  44.59 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.13 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  44.32 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.08 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.07 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  45.94 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  47.47 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  41.24 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  44.66 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.58 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  45.45 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  44.2 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.85 
 
 		 381 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.96 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  41.48 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.21 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  41.21 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  41.21 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  41.48 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  41.21 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  40.93 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.93 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  36.79 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.93 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.85 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  34.13 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.91 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28.53 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.91 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  30.37 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.02 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  25.52 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  29.79 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  30 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.96 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.96 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  29.47 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.11 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.75 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  28.09 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.29 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  25.15 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  29.25 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  24.56 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  29.03 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  29.21 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  28.63 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.46 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  26.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.91 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  25.96 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.64 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  27.8 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  28.43 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  28.77 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  24.91 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  25.11 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  28.89 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  23.48 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.05 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  28 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  26.61 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  28.23 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  27.12 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  28.25 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  29.72 
 
 		 314 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  23.75 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  23.48 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  27.54 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  27.83 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.25 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  26.79 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  30.52 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  31.43 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  27.8 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  28.49 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  27.16 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>