205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2019 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2019  ATPase  100 
 
 		 370 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  99.46 
 
 		 370 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  90.22 
 
 		 371 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  69.67 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.11 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  43.79 
 
 		 378 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.72 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.9 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  47.28 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.96 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  46.26 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  44.05 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.34 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.59 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.9 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  44.32 
 
 		 364 aa  278  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.94 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  43.09 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  41.35 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  46.63 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.54 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.3 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  42.82 
 
 		 366 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.82 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.26 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.9 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.23 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  41.14 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.27 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  40.44 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  42.53 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.19 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  40.4 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.14 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.39 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  39.39 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  39.39 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  39.11 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  39.11 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  39.11 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.39 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  39.11 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  38.83 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  38.1 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.83 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.11 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.54 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.06 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.32 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  29.21 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.49 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  29.3 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  28.87 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  26.7 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  25.59 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  27.37 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  28.64 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.54 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  26.27 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  28.44 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  27 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  27.57 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  25.98 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  26.03 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  27.57 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  27.51 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.32 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.44 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.44 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  29.17 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  27.03 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.58 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.42 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.88 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  28.12 
 
 		 303 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.89 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  28.5 
 
 		 291 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.86 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.86 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  27.81 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  25.65 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.86 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  26.41 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.29 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.6 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  26.9 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.13 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.05 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  26.84 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  29.25 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.62 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  23.98 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  28.02 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>