279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0330 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  889    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  58.48 
 
 		 351 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  43.2 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  40.31 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  46.47 
 
 		 373 aa  243  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  39.87 
 
 		 308 aa  233  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  39.51 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  41.55 
 
 		 307 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  39.56 
 
 		 304 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  39.39 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  40.07 
 
 		 311 aa  219  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  40 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  37.3 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  38.2 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  38.22 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  38.22 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.91 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.02 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  27.1 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  26.02 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  24.31 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  26.17 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.17 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.65 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  26.61 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.4 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  26.36 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.47 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.36 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  27.27 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  27.69 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  26.79 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  25.79 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  25.79 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.65 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  26.44 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  24.79 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.82 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.77 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  26.26 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  26.77 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  26.77 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  26.77 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.79 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.71 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  25.84 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.29 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.61 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  23.58 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  24.8 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.79 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  26.29 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  25.23 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  28.29 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  25.11 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  25.59 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  26.26 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  27.45 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  30.41 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  24.17 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  30.41 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  24.89 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  25.45 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  28.35 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.77 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  25.84 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  25.94 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  25.35 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  25.59 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.55 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  25.7 
 
 		 285 aa  67  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  27.41 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.55 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.18 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30.39 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  26.85 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  26.67 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.7 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  24.79 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.99 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  25.48 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.26 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  27.5 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  30.05 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.78 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.92 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  25.47 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  26.2 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  29.44 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  26.73 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  24.24 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  29 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  24.34 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  24.78 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  26.32 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  28.93 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  30.06 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.62 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  25.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  25.98 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>