More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2268 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.766024  hitchhiker  0.000226312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1077  protein of unknown function UPF0126  69.08 
 
 		 215 aa  249  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  51.58 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  39.3 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  37.89 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  37.25 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  38.89 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  37.76 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  37.57 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  38.41 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  37.69 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  33.66 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  32 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.84 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  39 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  35.4 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  38 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  36.97 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  42.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  37.06 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0584  hypothetical protein  38.31 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  36.14 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  35.53 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0991  hypothetical protein  41.18 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  38.18 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.25 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  37.62 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.25 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.25 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  36.68 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  35.43 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  38.12 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36.76 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  35.29 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34.78 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  36.63 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1575  protein of unknown function UPF0126  36.13 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  35.9 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.85 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  37.13 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1098  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  36.02 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  32.66 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  34.93 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  98.6  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2647  hypothetical protein  39.2 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  40.65 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  35.89 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.27 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  41.43 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  39.51 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  35.41 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  37.32 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1387  protein of unknown function UPF0126  40.62 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  36.02 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  38.31 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  34.8 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  40.79 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  34.31 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  37.97 
 
 		 223 aa  95.1  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  36.97 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  36.55 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  31.05 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  37.93 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  33.99 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3290  protein of unknown function UPF0126  37.63 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0211282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  40.51 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  31.61 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  39.13 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  39.13 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  38.35 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  36.08 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  36.08 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  33.66 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  36.08 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3173  hypothetical protein  37.63 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  36.08 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  34.74 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  31.48 
 
 		 263 aa  91.7  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  35.09 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  38.31 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  33.17 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  31.58 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>