More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3906 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.61 
 
 		 278 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.26 
 
 		 285 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.78 
 
 		 279 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.01 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  59.35 
 
 		 284 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.72 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.79 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.88 
 
 		 283 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.67 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  59.55 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  44.83 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  40.52 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  37.97 
 
 		 328 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  43.56 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  42.57 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  39.8 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  35.74 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  42.29 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  41.12 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  40.29 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  41.75 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  35.24 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  40.4 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  39.5 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  39.5 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  39.7 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  39.7 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  39.63 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  37.37 
 
 		 300 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  37.93 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  39.81 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  36.36 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 258 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.06 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132836  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.68 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.56 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  37.63 
 
 		 1270 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>