More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0314 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.79 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.82 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  35.74 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  35.36 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  35.05 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  35.46 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  38.17 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  36.23 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  36.63 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  35.13 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  36.63 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  34.17 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  33.1 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  33.1 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  35.04 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  34.8 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  33.94 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  32.38 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  34.43 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  45.51 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  34.05 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  33.68 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  30.38 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 252 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 592 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  29.56 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.2 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 		 239 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  27.31 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>