More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4561 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.32 
 
 		 288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.82 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.82 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.82 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  35.52 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  35.56 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  34.69 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  34.2 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  34.17 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  33.94 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  33.58 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  35.46 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  31.34 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  35.38 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  35.38 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  32.97 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  31.65 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  35.14 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  33.09 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  34.72 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  33.85 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 592 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.01 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 588 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 588 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 588 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  34.05 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  32.44 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  29.52 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.2 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  33.67 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  37.32 
 
 		 568 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 602 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>