More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0442 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.74 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.53 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.72 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  69.52 
 
 		 283 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  64.13 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.67 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.33 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 		 285 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.8 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  46.18 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  41.18 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  35.05 
 
 		 328 aa  168  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.27 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  37.68 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  37.68 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  36.84 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  37.38 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  38.66 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  33.8 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  35.9 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  36.19 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  34.62 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  34.47 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  35.61 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  37.2 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  29.69 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  33.49 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  28.48 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  33.18 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  29.3 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  36.21 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.31 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 596 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 596 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 596 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 		 596 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1368  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.194105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3976  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.78 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.91 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1470  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1230  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.824936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1207  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1209  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00888886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1405  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1330  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  38.65 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1429  acetoacetyl-CoA reductase  37.5 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1231  acetoacetyl-CoA reductase  38 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 602 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.72 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.39 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.39 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.43 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.08 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>