More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1705 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 278 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.39 
 
 		 279 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.14 
 
 		 285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.53 
 
 		 280 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.42 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.83 
 
 		 283 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.83 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.63 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  53.52 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  54.68 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  46.55 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  36.77 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  40.2 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  40.7 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  41.21 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  37.88 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  41.15 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  38.89 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  39.51 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  36.11 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  38.38 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  40.82 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  36.18 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  39.2 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  34.1 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  37.79 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  38.97 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  38.94 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  37.5 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  34.46 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  31.32 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.49 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.27 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 595 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 595 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 592 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>