More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2588 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.29 
 
 		 284 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.93 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.46 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  66.06 
 
 		 284 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.42 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  70.61 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.42 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.95 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.36 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  43.77 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  38.94 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  36.81 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  40.78 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  38.78 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  39.71 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  37.2 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  37.8 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  38.54 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  32.52 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  33.85 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 595 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  39.69 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  37.02 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 596 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 618 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 596 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 596 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 596 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 595 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 595 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  31.7 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  31.82 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.27 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  31.82 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  35.05 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.86 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 602 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  34.43 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.44 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  34.22 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  39.43 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 257 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.01 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 252 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 602 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 		 592 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>