More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02230 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  684    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  45.99 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.29 
 
 		 283 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  47.94 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  38.68 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  38.72 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  36.95 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  38.07 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  32.17 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159524  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  30.52 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  34.69 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 244 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  30.52 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  31.23 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  34.85 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 250 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 275 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 254 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  37.14 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  95.9  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 249 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 254 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.81 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.84 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.83 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 254 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 276 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  32.97 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 		 596 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 249 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 		 271 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 		 248 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  33.83 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 250 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  35.91 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 248 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 257 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 		 568 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  29.54 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.27 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 		 246 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  28.62 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  33.52 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 258 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 		 252 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.16 
 
 		 247 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  35.4 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>