More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1229 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.14 
 
 		 278 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.8 
 
 		 280 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.03 
 
 		 279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.71 
 
 		 283 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.65 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.8 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  57.2 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  57.68 
 
 		 283 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.8 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  46.05 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  40.4 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  40.71 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  45.13 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  36.65 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  43.98 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  44.04 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  42.93 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  42.56 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  39.62 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  40.49 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  38.25 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  38.25 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  35.11 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  39.45 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  37.06 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  38.42 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  38.89 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  39.7 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  42.42 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  38.19 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  37.88 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 602 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 602 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 602 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 		 590 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 		 592 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  41.06 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  36.88 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  43.98 
 
 		 595 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 596 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  43.46 
 
 		 595 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 596 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 596 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 596 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 595 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 595 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 595 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  43.46 
 
 		 618 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 590 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 568 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.87 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  35 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>