More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1641 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.72 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.72 
 
 		 286 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.61 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.55 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  66.3 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 		 283 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.37 
 
 		 283 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.03 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02230  conserved hypothetical protein  46.95 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.32 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34853  predicted protein  42.62 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116602  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05557  short chain dehydrogenase/reductase (AFU_orthologue; AFUA_2G00830)  35.66 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  42.86 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  34.04 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  38.81 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  35.71 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  38.42 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  37.11 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  36.23 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  37.62 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.21 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  31.91 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  37.07 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  31.91 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  35.61 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  38.51 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  34.38 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  35.48 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 595 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  38.73 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.28 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  29.27 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  29.08 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  33.01 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 		 595 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 596 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 595 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  37.07 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.54 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 596 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.54 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 596 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 596 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  29.5 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.5 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 618 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>