More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4404 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  100 
 
 		 943 aa  1872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.54 
 
 		 904 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  41.27 
 
 		 904 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  85.59 
 
 		 962 aa  1489    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  41.27 
 
 		 904 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  51.96 
 
 		 882 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  42.11 
 
 		 903 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.14 
 
 		 906 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 1043 aa  363  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  30.72 
 
 		 1017 aa  340  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  31.57 
 
 		 887 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  28.99 
 
 		 834 aa  280  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  27.14 
 
 		 831 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  24.75 
 
 		 828 aa  254  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  33.64 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  25.34 
 
 		 833 aa  231  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.87 
 
 		 867 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.26 
 
 		 869 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.26 
 
 		 867 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.77 
 
 		 901 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.28 
 
 		 901 aa  204  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.86 
 
 		 429 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  23.4 
 
 		 357 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  24.05 
 
 		 611 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  25.56 
 
 		 613 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  19.85 
 
 		 580 aa  91.3  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  22.99 
 
 		 617 aa  89  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  23.39 
 
 		 610 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8076  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  28.75 
 
 		 366 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  23.79 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  23.39 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  23.39 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  23.65 
 
 		 562 aa  85.9  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  23.65 
 
 		 562 aa  85.9  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  26.64 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  23.11 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  20.9 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  26.64 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  20.15 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  23.34 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.9 
 
 		 575 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.6 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.71 
 
 		 980 aa  80.1  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  24.34 
 
 		 1284 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  23.74 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  23.06 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  20.5 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.35 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  19.03 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  22.84 
 
 		 588 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  23.24 
 
 		 580 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.85 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  19.85 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  19.85 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  19.85 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  25.26 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.85 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  19.39 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  25.09 
 
 		 975 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.18 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  19.85 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  26.86 
 
 		 714 aa  75.1  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  19.31 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.57 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  22.36 
 
 		 590 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.15 
 
 		 1018 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  24.26 
 
 		 603 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  22.34 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  20.6 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  24.66 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  23.75 
 
 		 1321 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  22.76 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  26.74 
 
 		 718 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  24.01 
 
 		 601 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.63 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  21.91 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  19.35 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.69 
 
 		 1006 aa  72.8  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  23.4 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  21.91 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  21.61 
 
 		 589 aa  72  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.65 
 
 		 976 aa  72  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  26.45 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  20.05 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.49 
 
 		 601 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.05 
 
 		 585 aa  72  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  23.28 
 
 		 585 aa  72  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  20 
 
 		 650 aa  72  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.91 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.35 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  21.19 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.45 
 
 		 715 aa  71.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  28.93 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  21.59 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  22.92 
 
 		 603 aa  71.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  23.72 
 
 		 602 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  26.49 
 
 		 718 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  26.49 
 
 		 718 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  25.1 
 
 		 721 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>