More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5980 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.79 
 
 		 904 aa  1367    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.27 
 
 		 906 aa  984    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  96.9 
 
 		 904 aa  1790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  63.98 
 
 		 903 aa  1164    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  100 
 
 		 904 aa  1834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  41.65 
 
 		 962 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  41.27 
 
 		 943 aa  618  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  41.97 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  29.51 
 
 		 831 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 		 1017 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  28.15 
 
 		 834 aa  324  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 887 aa  318  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  27.34 
 
 		 833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  25.33 
 
 		 828 aa  301  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.24 
 
 		 867 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.65 
 
 		 867 aa  194  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.95 
 
 		 901 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.44 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.84 
 
 		 901 aa  190  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.04 
 
 		 861 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.86 
 
 		 429 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  25 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.99 
 
 		 721 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.29 
 
 		 574 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.29 
 
 		 574 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  22.74 
 
 		 617 aa  104  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  24.62 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.53 
 
 		 980 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  24.13 
 
 		 580 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  24 
 
 		 592 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.67 
 
 		 634 aa  99.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  22.13 
 
 		 585 aa  100  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  23.15 
 
 		 642 aa  99  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  21.48 
 
 		 586 aa  98.6  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.3 
 
 		 600 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  25.31 
 
 		 611 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  22.41 
 
 		 580 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.27 
 
 		 1024 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  23.91 
 
 		 575 aa  98.2  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  25.31 
 
 		 611 aa  97.8  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.83 
 
 		 1003 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  23.49 
 
 		 687 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  25.06 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  22.17 
 
 		 580 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.77 
 
 		 1008 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  23.41 
 
 		 648 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.77 
 
 		 1008 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  21.74 
 
 		 629 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  23.1 
 
 		 600 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  23.66 
 
 		 631 aa  95.5  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.88 
 
 		 603 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  24.31 
 
 		 975 aa  95.1  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.3 
 
 		 1001 aa  95.1  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.56 
 
 		 1000 aa  94.7  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  24.71 
 
 		 611 aa  94.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.13 
 
 		 613 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.25 
 
 		 602 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  23.02 
 
 		 617 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  22.54 
 
 		 597 aa  94  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  23.5 
 
 		 618 aa  94  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  20.49 
 
 		 586 aa  94  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  22.54 
 
 		 597 aa  94  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.01 
 
 		 702 aa  94  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.1 
 
 		 717 aa  93.2  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  21.89 
 
 		 575 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.22 
 
 		 1018 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.36 
 
 		 586 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  23.14 
 
 		 1018 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  24.58 
 
 		 582 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  23.65 
 
 		 612 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  23.14 
 
 		 663 aa  92.8  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.03 
 
 		 586 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 1006 aa  92.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  25.2 
 
 		 666 aa  92  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  25.05 
 
 		 649 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.61 
 
 		 586 aa  92  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.94 
 
 		 622 aa  91.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  22.77 
 
 		 600 aa  92  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  22.91 
 
 		 631 aa  92  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.49 
 
 		 1018 aa  91.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  21.72 
 
 		 632 aa  91.7  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  22.11 
 
 		 594 aa  91.3  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  22.35 
 
 		 357 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.04 
 
 		 586 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  20.68 
 
 		 586 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  22.22 
 
 		 584 aa  90.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  22.38 
 
 		 636 aa  90.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  20.68 
 
 		 586 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  21.8 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  23.16 
 
 		 613 aa  90.9  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  21.45 
 
 		 571 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  20.68 
 
 		 586 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  20.63 
 
 		 586 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.68 
 
 		 586 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.14 
 
 		 602 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.45 
 
 		 571 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  20.39 
 
 		 566 aa  89.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23 
 
 		 602 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  21.39 
 
 		 634 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>