More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2335 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 901 aa  1695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.6 
 
 		 869 aa  737    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  83.91 
 
 		 901 aa  1161    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.21 
 
 		 867 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.48 
 
 		 867 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  52.31 
 
 		 861 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  30.01 
 
 		 962 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  29.02 
 
 		 903 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.82 
 
 		 904 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  29.18 
 
 		 943 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  26.14 
 
 		 904 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  25.87 
 
 		 904 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.03 
 
 		 906 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  28.71 
 
 		 882 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  28.14 
 
 		 831 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 887 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  28.99 
 
 		 834 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  26.58 
 
 		 828 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  23.51 
 
 		 833 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  32.2 
 
 		 723 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  27.08 
 
 		 1017 aa  73.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  27.97 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  26.4 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  26.4 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  28.65 
 
 		 763 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 763 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  35.45 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  39.17 
 
 		 871 aa  65.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  40.4 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0507  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.06 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.77 
 
 		 579 aa  63.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  31.82 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  31.82 
 
 		 712 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  28.24 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3526  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.56 
 
 		 594 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  34.65 
 
 		 605 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  41.56 
 
 		 743 aa  60.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  34.65 
 
 		 605 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  37.31 
 
 		 255 aa  60.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  26.12 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  23.91 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  45 
 
 		 721 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  43.04 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  22.81 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  21.63 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 1218 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  40.19 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  32.93 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  40.51 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  36.71 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.65 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  25.79 
 
 		 578 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  26.22 
 
 		 630 aa  57.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  39.73 
 
 		 725 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  34.75 
 
 		 779 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  31.11 
 
 		 718 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  36.46 
 
 		 720 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  41.1 
 
 		 723 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  41.46 
 
 		 740 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.5 
 
 		 610 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  35.44 
 
 		 725 aa  57  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 1332 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 616 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  37.5 
 
 		 610 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  31.46 
 
 		 687 aa  57  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  37.97 
 
 		 725 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  38.36 
 
 		 725 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3546  ABC transporter related  34.38 
 
 		 573 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  37.5 
 
 		 610 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.51 
 
 		 606 aa  56.6  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00333  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  37.04 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.51 
 
 		 596 aa  56.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  25.47 
 
 		 615 aa  55.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.25 
 
 		 725 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  36.67 
 
 		 605 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.74 
 
 		 597 aa  56.2  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  35.71 
 
 		 718 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 		 694 aa  56.2  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  28.48 
 
 		 586 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  27.64 
 
 		 612 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  26.47 
 
 		 572 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.46 
 
 		 1284 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  36.36 
 
 		 1230 aa  55.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5944  ABC transporter related  33.55 
 
 		 592 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  24.53 
 
 		 589 aa  55.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2164  ABC transporter transmembrane region  34.59 
 
 		 585 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  34.02 
 
 		 721 aa  55.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  35.44 
 
 		 725 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.23 
 
 		 617 aa  55.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  35.44 
 
 		 725 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.97 
 
 		 619 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  35.44 
 
 		 725 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  35.44 
 
 		 725 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  27.97 
 
 		 712 aa  54.7  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  36.99 
 
 		 727 aa  54.7  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0740  cytochrome D ABC transporter ATP binding and permease protein  25.69 
 
 		 573 aa  54.7  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.253715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  24.67 
 
 		 579 aa  54.7  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>