More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0275 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  58.45 
 
 		 867 aa  788    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  58.66 
 
 		 869 aa  765    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 901 aa  1692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  83.91 
 
 		 901 aa  1161    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  58.62 
 
 		 867 aa  764    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  53.08 
 
 		 861 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  36.83 
 
 		 962 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  28.99 
 
 		 903 aa  224  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  28.43 
 
 		 943 aa  221  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.43 
 
 		 904 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  25.85 
 
 		 904 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  26.09 
 
 		 904 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.57 
 
 		 906 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.64 
 
 		 882 aa  161  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  28.37 
 
 		 831 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  27.8 
 
 		 887 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  27.3 
 
 		 834 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  24.11 
 
 		 833 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  25.05 
 
 		 828 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 1017 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  28.22 
 
 		 631 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  28.96 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  28.41 
 
 		 584 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  31.2 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.22 
 
 		 579 aa  70.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  26.59 
 
 		 1332 aa  68.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  41.51 
 
 		 569 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  21.12 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  21.05 
 
 		 605 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  22.52 
 
 		 596 aa  63.9  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  26.45 
 
 		 612 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.25 
 
 		 597 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  25.73 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  28.96 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  22.89 
 
 		 588 aa  62.4  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  25.73 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0507  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.74 
 
 		 561 aa  62  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.17 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  42.86 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 613 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  32.96 
 
 		 618 aa  60.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  24.26 
 
 		 589 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  29.48 
 
 		 1230 aa  60.1  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  27.3 
 
 		 763 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.3 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.3 
 
 		 763 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.61 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  26.57 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  37.04 
 
 		 871 aa  59.3  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  25.11 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  24.28 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  29.46 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  34.72 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  26.6 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  22.02 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  38.46 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  24.75 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  24.94 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  23.36 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  32.65 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  21.79 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.17 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  26.4 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  23.45 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  36.89 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  17.77 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  17.77 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.75 
 
 		 1377 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  26.33 
 
 		 578 aa  57.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  28.43 
 
 		 577 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  25.14 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.48 
 
 		 711 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  24.34 
 
 		 603 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3546  ABC transporter related  40 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  22.51 
 
 		 586 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  23.46 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  20.57 
 
 		 699 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3526  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.44 
 
 		 594 aa  57.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  26.27 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.45 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  26.81 
 
 		 605 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  23.78 
 
 		 591 aa  57  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  20.33 
 
 		 695 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 		 612 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  26.36 
 
 		 613 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  36.42 
 
 		 647 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  27.78 
 
 		 585 aa  57  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  35.11 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00333  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  37.5 
 
 		 561 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.6 
 
 		 610 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.71 
 
 		 782 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5944  ABC transporter related  32.26 
 
 		 592 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  27.22 
 
 		 718 aa  55.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.6 
 
 		 610 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  30.26 
 
 		 712 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>