More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4458 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  94.69 
 
 		 867 aa  1406    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  99.54 
 
 		 867 aa  1645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.03 
 
 		 901 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 869 aa  1654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.51 
 
 		 861 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  58.23 
 
 		 901 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  36.85 
 
 		 962 aa  234  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.3 
 
 		 904 aa  232  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  27 
 
 		 903 aa  226  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  34.75 
 
 		 943 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  30.85 
 
 		 904 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  30.44 
 
 		 904 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.99 
 
 		 906 aa  172  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.91 
 
 		 882 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  25.34 
 
 		 831 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 887 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  23.35 
 
 		 833 aa  121  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  26.31 
 
 		 834 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  23.45 
 
 		 828 aa  108  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  28.07 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 		 579 aa  77.4  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5944  ABC transporter related  41.55 
 
 		 592 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  25.38 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  29.61 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  23.31 
 
 		 1043 aa  75.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  27.8 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  36.21 
 
 		 577 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.13 
 
 		 580 aa  73.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  31.51 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3591  hypothetical protein  31.27 
 
 		 588 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0726978  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.61 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  26.27 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  25.57 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  28.19 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.16 
 
 		 616 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  27.59 
 
 		 782 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  24.76 
 
 		 1017 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 623 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  33.21 
 
 		 1230 aa  69.7  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.03 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  34.38 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.76 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.66 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  25.42 
 
 		 814 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.93 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  22.8 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  30.39 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  25.42 
 
 		 768 aa  67.8  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  25.89 
 
 		 589 aa  67.4  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.38 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5945  ABC transporter related  33.75 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  26.98 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.33 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  25.06 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.8 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  29.56 
 
 		 617 aa  65.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.46 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  26.07 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.91 
 
 		 609 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.91 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2232  ABC transporter related  22.11 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.67 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.95 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  23.98 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  34.18 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  45.12 
 
 		 1284 aa  64.7  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  36.71 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  22.54 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.07 
 
 		 623 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  24.11 
 
 		 589 aa  63.9  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.08 
 
 		 764 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  31.72 
 
 		 577 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  24.07 
 
 		 654 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.31 
 
 		 595 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 623 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.08 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 623 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.61 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  22.73 
 
 		 605 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  26.11 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  25.2 
 
 		 576 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  34.29 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 623 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 587 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  25.86 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.96 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  22.32 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  23.91 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.39 
 
 		 1024 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  27.91 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  25 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  25.98 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.15 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.27 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>