More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4972 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  56.54 
 
 		 901 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  94.46 
 
 		 867 aa  1358    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  94.69 
 
 		 869 aa  1364    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.94 
 
 		 901 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  56.94 
 
 		 861 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 867 aa  1648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.79 
 
 		 904 aa  235  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  27.2 
 
 		 903 aa  231  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  36.11 
 
 		 962 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  26.94 
 
 		 904 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  32 
 
 		 943 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  26.45 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.57 
 
 		 906 aa  185  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.84 
 
 		 882 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  29.58 
 
 		 831 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  30.53 
 
 		 887 aa  144  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  26.32 
 
 		 834 aa  122  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  23.06 
 
 		 833 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  25.78 
 
 		 828 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5944  ABC transporter related  41.55 
 
 		 592 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  27.86 
 
 		 584 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  23.24 
 
 		 1043 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 		 579 aa  76.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  38.41 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  30.53 
 
 		 1230 aa  73.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  27.52 
 
 		 723 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  27.78 
 
 		 631 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.02 
 
 		 580 aa  72  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.23 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  29.18 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  25.05 
 
 		 1017 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  26.23 
 
 		 760 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3591  hypothetical protein  30.7 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0726978  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 595 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  27.22 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.58 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.27 
 
 		 1284 aa  68.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  24.94 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  35.91 
 
 		 745 aa  67.4  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  34.25 
 
 		 572 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  24.75 
 
 		 814 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  25.28 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 623 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.81 
 
 		 635 aa  66.6  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.91 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.91 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  24.75 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  24.12 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  27 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.78 
 
 		 583 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  24.38 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  26.51 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2232  ABC transporter related  22.47 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  28.36 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  24.62 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  32.4 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  24.63 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  25 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  24.78 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.56 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  25.93 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  38.93 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  30.81 
 
 		 597 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  27.2 
 
 		 579 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  39.02 
 
 		 610 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  25.79 
 
 		 721 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  24.11 
 
 		 613 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  28.04 
 
 		 782 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  29.02 
 
 		 687 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  26.67 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  25.46 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.42 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  26.28 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.29 
 
 		 610 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  24.36 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13640  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  28.33 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.29 
 
 		 610 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  22.66 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  34.29 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  26.77 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.7 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.71 
 
 		 1024 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  34.87 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  34.29 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.74 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  28.54 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  28.24 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  24.14 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  32.81 
 
 		 725 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  27.78 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  31.16 
 
 		 577 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  32.47 
 
 		 738 aa  62  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.02 
 
 		 720 aa  62  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  22.9 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 		 590 aa  62  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.11 
 
 		 606 aa  62  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>