More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1045 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.47 
 
 		 869 aa  747    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.03 
 
 		 867 aa  766    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 861 aa  1645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  57.13 
 
 		 867 aa  743    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  52.26 
 
 		 901 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  52.85 
 
 		 901 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  35.1 
 
 		 962 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  33.64 
 
 		 943 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.35 
 
 		 904 aa  199  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  26.81 
 
 		 903 aa  193  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  26.04 
 
 		 904 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  25.64 
 
 		 904 aa  184  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.73 
 
 		 906 aa  169  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.79 
 
 		 882 aa  164  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  30.3 
 
 		 831 aa  145  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 		 887 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  26.49 
 
 		 828 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  25.99 
 
 		 834 aa  108  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  22.8 
 
 		 833 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  26.91 
 
 		 1017 aa  72.4  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  43.36 
 
 		 1284 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  37.23 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 593 aa  65.1  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  40.95 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  35.46 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  29.91 
 
 		 712 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  26.67 
 
 		 573 aa  62  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  29.93 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  28.15 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  35.11 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 1043 aa  61.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3378  ABC transporter related  34.86 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  35.71 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  35.71 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  35.71 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  34.55 
 
 		 720 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.3 
 
 		 583 aa  60.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  35.71 
 
 		 1230 aa  60.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  35.71 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  31.78 
 
 		 521 aa  60.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  33.01 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  32.08 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.86 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  33.58 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  32.68 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  40.43 
 
 		 721 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.12 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  26.45 
 
 		 608 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.12 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  35.71 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  37 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.09 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  34.26 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  33.67 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.17 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  34.04 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  35.51 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  27.82 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00333  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.19 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  32.62 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.5 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  30.17 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  34.56 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  34.69 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  37.5 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  33.67 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  33.67 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  33.67 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.83 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  30.77 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  34.69 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  21.2 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  33.67 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  33.12 
 
 		 577 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3493  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.73 
 
 		 579 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.59 
 
 		 725 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5944  ABC transporter related  36.3 
 
 		 592 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  34.34 
 
 		 584 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.63 
 
 		 610 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.63 
 
 		 610 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  35.51 
 
 		 740 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0507  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 561 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  33.33 
 
 		 745 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 613 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  27.2 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  29.21 
 
 		 687 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  33.67 
 
 		 723 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  34.13 
 
 		 596 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  30.84 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  22.09 
 
 		 629 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  21.4 
 
 		 649 aa  56.2  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 		 726 aa  55.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  24.77 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  25 
 
 		 575 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  29.5 
 
 		 583 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>